Mika viaja a las tierras de Yomi, donde habitan las almas de los muertos, en busca de su mejor amiga fallecida Mitsuha. Sus acompañantes son una divinidad con gran interés por el comportamiento humano ante la muerte y Hibino, un humano inmortal cuyo único propósito es encontrar a su media naranja. Este excéntrico grupo inicia la travesía visitando los templos y santuarios de Japón, donde se topan con todo tipo de personas cercanas a la muerte. Curiosamente, todas ellas comparten los remordimientos por no haber cumplido algunos de sus deseos cuando aún tenían tiempo. En su periplo, Mika rememora los momentos con Mitsuha antes de perderla, mientras la culpa le reconcome… ¿Cuándo llegarán a esa tierra de los muertos para poder al fin reencontrarse con su mejor amiga?